عن عطاء المكي قال ما رأيت العلماء عند أحد قط أصغر منهم عند أبي جعفر محمد بن علي بن الحسين ولقد رأيت الحكم بن عيينة مع جلالته في القوم بين يديه كأنه صبي بين يدي معلمه.

وكان جابر بن يزيد الجعفي إذا روى عن محمد بن علي (عليه السلام) شيئا قال حدثني وصي الأوصياء و وارث علم الأنبياء محمد بن علي بن الحسين (عليه السلام).

وروى مخول بن إبراهيم عن قيس بن الربيع قال سألت أبا إسحاق عن المسح على الخفين قال أدركت الناس يمسحون حتى لقيت رجلا من بني هاشم لم أر مثله قط محمد بن علي بن الحسين فسأله عن المسح فنهاني عنه و قال لم يكن علي أمير المؤمنين (عليه السلام) يمسح و كان يقول سبق الكتاب المسح على الخفين قال أبو إسحاق فما مسحت منذ نهاني عنه قال قيس بن الربيع و ما مسحت أنا منذ سمعت أبا إسحاق .

وقد روى أبو جعفر (عليه السلام) أخبار المبتدأ و أخبار الأنبياء و كتب الناس عنه المغازي و آثروا عنه السير و السنن و اعتمدوا عليه في مناسك الحج التي رواها عن النبي (صلى الله عليه واله) و كتبوا عنه تفسير القرآن و روت عنه الخاصة و العامة الأخبار و ناظر من كان يرد عليه من أهل الآراء و حفظ عن الناس كثيرا من علم الكلام.