اعتمد تصنيف الإنزيمات الحديث إلى تقسيمها إلى ست مجاميع رئيسية أكثر سهولة ودقة اعتمادا على نوع واليات التفاعل وكل قسم إلى تحت قسم ولكل قسم وتحت قسم رقم معين يدل عليه وكل تحت قسم إلى فرع وكل فرع يشمل مجموعة من الإفراد ولكل منهما رقم معين وفي هذا التقسيم يعبر عن الإنزيم بأربعة أقسام ويدل الرقم الأول على القسم والرقم الثاني على تحت القسم والرقم الثالث على النوع والرقم الرابع على الإنزيم، ويفصل بين الأرقام الأربعة نقاط وتسبق بحرفين هما EC يسمى  .code number