يمكن تنظيم نشاط الإنزيمات بواسطة انحلال البروتين مثل تحويل الببسينوجين التربسينوجين، الكيموتربــــــين و procarboxy peptidase إلى أشكالها الفعالة ويمكن تنشيط hosphorylase B kinase أو تحويل glycogen synthetae المعتمد على الكلوكوز -6- فوسفيت إلى الشكل غير المعتمد عليه بواسطة تحلل البروتينات المحدود كما يلعب تحلل البروتين المحدود دوراً مهماً في تنظيم نشاط الإنزيم المهم في تخثر الدم كما يمكن  تحويل fibrinogen إلى fibrin بواسطة إنزيم thrombin بواسطة تحلل البروتين المحدود الموجود تحت الظروف الفسيولوجية الاعتيادية وهو إنزيم البروثرومبين غير عندما الفعال حيث ينشط بسلسلة من التفاعلات الذي تتضمن تفاعلات تنشيطية منظمة.