الظروف التي يفضل فيها النظام المنفصل: 

1- عند وجود شبكة صرف لمياه الأمطار قبل إنشاء شبكة الصرف الصحي فعندئذ يحسن الإبقاء على هذه الشبكة لتقوم بالخدمة التي أنشئت لها فعلاً مع إنشاء شبكة جديدة تكفي لحمل المخلفات السائلة الأخرى فقط.

2- إذا ظهر ان مياه الأمطار يمكن صرفها بالانحدار الطبيعي (بدون رفع) في مجرى مائي أو نهر أو بحيرة مجاورة للمدينة فيمكن في هذه الحالة إنشاء شبكة صرف منفصلة وذلك توفيراً لتكاليف رفعها مع بقية المخلفات السائلة.

3- إذا كانت تكاليف معالجة المخلفات السائلة مرتفعة, ففي هذه الحالة يحسن فصل مياه الأمطار عن المخلفات الأخرى مع التخلص منها بدون معالجة وذلك اقتصاداً في تكاليف المعالجة.