اتخذ الإمام (عليه السلام) الجامع النبوي مركزا لمدرسته و معهدا له فكان في بهوه يلقي محاضراته و بحوثه على العلماء و الفقهاء و قد تناولت علم الفقه و التفسير و الحديث و الفلسفة و علم الكلام و قواعد السلوك و الأخلاق .

يقول المؤرخون: أنه كان في كل جمعة يلقي خطابا عاما على الناس يعظهم فيه و يزهدهم في الدنيا و يرغبهم في الآخرة و كان الناس يحفظون كلامه و يكتبونه‏  و من الجدير بالذكر أن مجلسه كان لا يخلو من المذاكرات و الفوائد العلمية يقول عبد الله بن الحسن بن الحسن أن أمي فاطمة بنت الحسين كانت تأمرني أن أجلس إلى خالي علي بن الحسين فما جلست إليه قط إلا قمت بخير قد أفدته إما خشية للّه أو علم قد استفدته منه‏ .

احتف العلماء الفقهاء و القراء بالإمام (عليه السلام) لا يفارقونه في حضر أو سفر فكان إذا أراد السفر إلى بيت اللّه الحرام رافقه زهاء ألف عالم و قارء  و هم يسجلون فتاواه و ما يلقيه عليهم من العلوم و غرر الحكم و الآداب .