إنّ الاستخدام غير المتوازن للأسمدة الكيميائيّة يُلحق الضرر بالبيئة المحيطة بالتربة أيضاً، ومنها: القضاء على الثروة الحيوانية التي تتغذّى على الغطاء النباتي الذي يحتوي على كميات كبيرة من النتروجين وبالتالي يؤدي إلى تسممها, إطلاق النباتات لغاز ثاني أكسيد النتروجين إثر تخزينه في الصوامع، وبالتالي تخمرّه فيلحق الضرر بصحّة العاملين, ارتفاع نسبة البكتيريا الضارة في التربة إثر ارتفاع مستوى النتروجين في التربة.